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购买种子是否违法，取决于购买的种子是否符合法律规定。如果国外购买的种子经过合法程序，符合进口国的法律法规，那么购买行为就不违法。但如果未经许可或违反相关法规进口种子，就可能涉及违法行为。
对于如何处理这种情况，需要根据具体情况进行判断，如果相关部门认定购买的种子违法，可能会采取一些措施，如罚款、没收种子等，还可能涉及跨国法律问题，需要遵守不同国家的法律法规，建议在购买种子之前，了解相关法律法规和程序，确保购买的种子合法合规，如果无法确定购买的种子是否合法，建议咨询当地的农业部门或法律专业人士，以获得准确的建议和指导。